Les dépôts s’apparentent à un prêt à long terme, d’un ou plusieurs spécimens, selon des modalités définies par convention, entre deux institutions ou avec une personne physique.
Le dépôt peut être réalisé pour diverses raisons :
- Des expositions
- Des études
- La gestion lorsque le déposant n’a pas les ressources nécessaires
Actuellement deux collections propriété de l’Université de Bordeaux sont en dépôt au Muséum de Bordeaux, l’une de minéralogie et pétrographie (collection R. Gay) et l’autre de spécimens en flacons, principalement composée de reptiles et de poissons.
Inversement, des spécimens des collections du Muséum de Bordeaux sont en dépôt auprès d’autres institution.
Des coquillages et dents de poissons sont en dépôt pour exposition à la Réserve naturelle Géologique de Saucats-La Brède et des otolithes des poissons – osselets de l’oreille – sont en dépôt pour étude à l’Institut Royal des Sciences naturelles de Belgique à Bruxelles.